《温疫论补注》是清代医家吴有性（字又可）所著的一部重要温病学著作，由郑重光（字在辛）补注。本书成书于明末清初，是中医温病学派的奠基之作，系统阐述了温疫的病因、病机、诊断和治疗方法。

全书分为上下两卷，上卷主要论述温疫的病因病机、诊断要点和治疗方法，提出了“杂气致病”的理论，认为温疫是由天地间的杂气（戾气）引起，而非传统的风寒暑湿等六气。下卷则详细讨论了温疫的各种变证和治疗方法，包括战汗、自汗、盗汗、发斑、畜血等证候的辨证施治。

吴有性在书中首创“达原饮”等方剂，强调温疫治疗应以疏利透达为主，反对滥用寒凉药物。郑重光的补注则对原文进行了详细解释和补充，使理论更加完善。本书对后世温病学的发展产生了深远影响，是研究中医温病学的重要文献。